Amidasi (AMD)
Enzimi:Sono catalizzatori biologici macromolecolari, la maggior parte degli enzimi sono proteine
Amidasi:Catalizzano l'idrolisi di varie ammidi alifatiche e aromatiche, sia endogene che estranee, trasferendo un gruppo acilico all'acqua con produzione di acidi liberi e ammoniaca. Gli acidi idrossamici e altri acidi organici sono ampiamente utilizzati come farmaci in quanto componenti di fattori di crescita, antibiotici e inibitori tumorali. Le amidasi possono essere suddivise in acilasi di tipo R e di tipo S in base alla stereoselettività del catalizzatore.
Oltre a catalizzare l'idrolisi delle ammidi, l'amidasi può anche catalizzare reazioni di trasferimento acilico in presenza di co-substrati come l'idrossilammina.
Le amidasi di diversa origine presentano una specificità di substrato differente: alcune idrolizzano solo ammidi aromatiche, altre solo ammidi alifatiche, e altre ancora ammidi α- o ω-amminiche. La maggior parte delle ammine mostra una buona attività catalitica solo per le ammidi acicliche o aromatiche semplici, mentre per le ammidi aromatiche complesse, eterocicliche e soprattutto quelle con sostituenti in posizione orto, l'attività è generalmente bassa (solo pochi enzimi mostrano effetti catalitici migliori).
Meccanismo catalitico:
| Enzimi | Codice prodotto | Codice prodotto |
| Polvere enzimatica | ES-AMD-101~ ES-AMD-119 | un set di 19 amidasi, 50 mg ciascuna 19 articoli * 50 mg / articolo, o altra quantità |
| Kit di screening (SynKit) | ES-AMD-1900 | un set di 19 amidasi, 1 mg ciascuna 19 articoli * 1 mg / articolo |
★ Elevata specificità del substrato.
★ Elevata selettività chirale.
★ Elevata efficienza di conversione.
★ Meno sottoprodotti.
★ Condizioni di reazione lievi.
★ Rispettoso dell'ambiente.
➢ A causa della specificità del substrato, è necessario effettuare uno screening enzimatico per substrati specifici, al fine di ottenere un enzima che catalizzi il substrato target con il miglior effetto catalitico.
➢ Non esporre mai a condizioni estreme quali: temperature elevate, pH elevato/basso e solventi organici ad alta concentrazione.
➢ Normalmente, il sistema di reazione dovrebbe includere il substrato e la soluzione tampone (il pH ottimale di reazione dell'enzima). Nel sistema di reazione di trasferimento acilico dovrebbero essere presenti co-substrati come l'idrossilammina.
➢ L'AMD deve essere aggiunto per ultimo al sistema di reazione, mantenendo il pH e la temperatura di reazione ottimali.
➢ Tutti i tipi di AMD hanno diverse condizioni di reazione ottimali, quindi ognuno di essi dovrebbe essere ulteriormente studiato individualmente.
Esempio 1(1):
Attività di idrolisi su diversi substrati ammidici
| Substrato | Attività specifica μmol min-1mg-1 | Substrato | Attività specifica μmol min-1mg-1 |
| Acetammide | 3.8 | ο-OH benzammide | 1.4 |
| Propionimmide | 3.9 | p-OH benzammide | 1.2 |
| Lattamide | 12.8 | ο-NH2benzammide | 1.0 |
| Butiramide | 11.9 | p-NH2benzammide | 0,8 |
| isobutiramide | 26.2 | ο-Toluamide | 0,3 |
| Pentanamide | 22.0 | p-Toluamide | 8.1 |
| Esanamide | 6.4 | Nicotinammide | 1.7 |
| Cicloesanamide | 19.5 | Isonicotinammide | 1.8 |
| Acrilammide | 10.2 | Picolinamide | 2.1 |
| Metacrilammide | 3.5 | 3-fenilpropionammide | 7.6 |
| Prolinamide | 3.4 | Indolo-3-acetammide | 1.9 |
| Benzamide | 6.8 |
La reazione è stata condotta in una soluzione tampone di fosfato di sodio 50 mM, a pH 7,5, a 70 °C.
| Ammidi | Idrossilammina | Idrazina |
| Acetammide | 8.4 | 1.4 |
| Propionimmide | 18.4 | 3.0 |
| isobutiramide | 25.0 | 22.7 |
| Benzamide | 9.2 | 6.1 |
La reazione è stata condotta in una soluzione tampone di fosfato di sodio 50 mM, a pH 7,5, a 70 °C.
Concentrazione dei reagenti correlati: ammidi, 100 mM (benzammide, 10 mM); idrossilammina e idrazina, 400 mM; enzima 0,9 μM.
Esempio 2(2):
Esempio 3(3):
1. D'Abusco AS, Ammendola S., et al. Estremofili, 2001, 5:183-192.
2. Guo FM, Wu JP, Yang LR, et al. Process Biochemistry, 2015, 50(8): 1400-1404.
3. Zheng RC, Jin JQ, Wu ZM, et al. Chimica bioorganica, 2017, Disponibile online 7.
